Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms