Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms