Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc1Q69ZZ6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms