Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Jmjd1cQ69ZK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Jmjd1cQ69ZK6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms