Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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