Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms