Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms