Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms