Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms