Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttf1Q62187 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ttf1Q62187 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ttf1Q62187 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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