Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EsrrbQ61539 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms