Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms