Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PapolaQ61183 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms