Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp17laQ61068 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms