Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sim1Q61045 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms