Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms