Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms