Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms