Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms