Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms