Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms