Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms