Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms