Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf1Q5ND28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarf1Q5ND28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms