Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GpkowQ56A08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GpkowQ56A08 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms