Protein–RNA interactions for Protein: Q50H33

Kctd8, BTB/POZ domain-containing protein KCTD8, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd8Q50H33 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kctd8Q50H33 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kctd8Q50H33 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms