Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf38aQ4FK66 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms