Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms