Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Usp48Q3V0C5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Usp48Q3V0C5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp48Q3V0C5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp48Q3V0C5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp48Q3V0C5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp48Q3V0C5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Usp48Q3V0C5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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