Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm44Q3V089 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm44Q3V089 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm44Q3V089 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm44Q3V089 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms