Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim80Q3V061 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim80Q3V061 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms