Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms