Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim40Q3UWA4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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