Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca4bQ3UW98 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms