Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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