Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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