Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef40Q3UPH7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef40Q3UPH7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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