Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms