Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms