Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms