Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms