Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U595 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U595 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U595 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms