Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hectd3Q3U487 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hectd3Q3U487 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms