Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam117bQ3U3E2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam117bQ3U3E2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms