Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms