Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms