Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl4Q3TZA2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl4Q3TZA2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms