Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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