Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp39Q3TIX9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms