Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms